Su nombre fue tomado de la sobrina del cacique Calarcá, perteneciente a la tribu de los pijaos de la cultura indígena Quimbaya, quienes inicialmente habitaron este municipio. El barrio "Ciudad Boquía" inicia con 597 soluciones de vivienda y fue inaugurado el 28 de junio de 1991, por entonces el ministro de desarrollo el doctor Ernesto Samper Pizano y bajo el gobierno del presidente el doctor Cesar Gaviria Trujillo. 

A partir de esta fecha comienza la adjudicación de viviendas, calculando una población escolar promedio de 800 menores para educación básica primaria, razón por la cuál surge la necesidad de tener dentro del barrio una institución educativa para evitar peligros que ocasionan el desplazamiento hacía otras instituciones educativas y la erogación de los gastos que ello incluye. Ante esta gran dificultad surgió al interior de la primera junta de acción comunal y demás habitantes del sector, la idea de realizar un proyecto de construcción y dotación de una institución educativa con las necesidades de la época. 

El proyecto fue elaborado y presentado a la Secretaria de Educación Municipal de Pereira, allí contó con gran apoyo, dándose comienzo al proceso de gestión y dinamismo requerido para la dotación de esta institución educativa. Entre tanto, la comunidad requería una solución a corto plazo, por lo cual solicitó al gerente del INURBE, el préstamo de la Casa modela de la urbanización Ciudad Boquía. En 1992, fue debido a que fueron adjudicadas nuevas soluciones de vivienda, surge la necesidad de nuevos cupos escolares y de ampliar la planta de personal docente al igual que la infraestructura que permitiera albergar un mayor número de estudiantes. Entre 1994 y 1996 es construida la actual planta física y mediante acuerdo número 51 del Honorable Concejo Municipal, se crea el colegio Ciudad Boquía.